Les deux principaux organes décisionnels du CCRE sont le Comité directeur et le Bureau exécutif.
Le constitue le principal organe décisionnel ; il se réunit généralement deux fois par an. Sa composition reflète les composantes nationales du CCRE selon une échelle allant de 2 sièges pour les Etats de moins de 5 millions d'habitants à six sièges pour les Etats de plus de 60 millions d'habitants.
Le est plus restreint ; il prend les décisions entre deux réunions du Comité directeur. Lui-même se réunit normalement deux fois par an.
Le du CCRE et les autres membres de la présidence (voir ci-dessous) sont élus par le Comité directeur pour des mandats de trois ans. Le CCRE a aussi neuf vice présidents.
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